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改進(jìn)型“基因魔剪”揭秘非編碼RNA功能 有助發(fā)現(xiàn)癌癥診療新指標(biāo)和新靶點(diǎn)

2024-11-12 09:52:19  |  來 源:科技日報  點(diǎn)擊:

科技日報北京11月11日電 (記者張夢然)人類基因組中大約98%的區(qū)域并不直接編碼蛋白質(zhì),這部分區(qū)域的功能一度未被充分理解,甚至被誤認(rèn)為是“垃圾”DNA。然而據(jù)最新一期《細(xì)胞》雜志上發(fā)表的研究,科學(xué)家借助改進(jìn)型“基因魔剪”CRISPR技術(shù)揭示了非編碼RNA的奧秘,證明了它們在細(xì)胞中,特別是在癌癥和人類發(fā)育過程中,扮演著不可或缺的角色。

CRISPR技術(shù)通常以Cas9酶為核心,但本次研究采用了更為前沿的方法——利用Cas13酶針對RNA進(jìn)行操作。美國紐約大學(xué)和紐約基因組中心科學(xué)家對5種人類細(xì)胞系進(jìn)行了深入分析,包括腎臟細(xì)胞、白血病細(xì)胞以及乳腺癌細(xì)胞等。他們系統(tǒng)探究了近6200個長鏈非編碼RNA(lncRNA)基因位點(diǎn)及其鄰近蛋白質(zhì)編碼基因的影響。通過實(shí)施CRISPR介導(dǎo)的干擾或敲除實(shí)驗(yàn),他們評估了每個lncRNA對細(xì)胞健康的重要性,從而識別出哪些是非必要的,哪些是維持細(xì)胞基本功能所必需的。

最終,他們發(fā)現(xiàn)了總計778個對細(xì)胞生存至關(guān)重要的lncRNA,其中包括46個廣泛存在于多種細(xì)胞類型中的核心lncRNA,以及732個僅在特定細(xì)胞類型中發(fā)揮關(guān)鍵作用的lncRNA。這些重要的lncRNA參與調(diào)控細(xì)胞生長周期中的重要路徑,如果缺乏可能導(dǎo)致細(xì)胞停滯甚至死亡。

研究還揭示了lncRNA在人類發(fā)育過程中的重要作用。許多此類RNA分子在胚胎早期組織中高度活躍,隨著個體的成長逐漸減少表達(dá)量,這表明它們在生命早期階段具有特殊功能。對于癌癥研究而言,通過對大約9000個腫瘤樣本的分析,科學(xué)家注意到,在特定類型的腫瘤中,lncRNA的表達(dá)水平與患者存活率之間存在關(guān)聯(lián)。

非編碼RNA可能成為未來癌癥診療的新指標(biāo)和新靶點(diǎn),其獨(dú)特的細(xì)胞類型特異性表達(dá)也為實(shí)現(xiàn)個性化醫(yī)療提供了可能。這一發(fā)現(xiàn)無疑是基因組學(xué)研究領(lǐng)域的一個里程碑事件,預(yù)示著未來生物學(xué)研究和臨床實(shí)踐將開啟全新的篇章。

【總編輯圈點(diǎn)】

非編碼RNA分子在細(xì)胞中扮演著不可或缺的角色,雖然不直接參與裝配蛋白質(zhì),它們的異常卻會導(dǎo)致多種疾病。一度被生物學(xué)家低估的RNA遺傳機(jī)制,其實(shí)并不邊緣。非編碼RNA與蛋白質(zhì)、DNA及其他RNA分子相互作用,形成復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。這一網(wǎng)絡(luò)不僅調(diào)節(jié)基因表達(dá),還參與細(xì)胞內(nèi)的信號傳導(dǎo)和代謝過程,最終成就了生物的高度多樣性和靈活的適應(yīng)性。未來隨著實(shí)驗(yàn)觀測手段不斷升級,或許還會有更多讓我們意想不到的生命路徑被照亮。


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