辦法共有17條條款，主要從法律依據和工作原則、責任和分工、情形頻次和方法內容、政策和保障共4個方面，聚焦防范和化解傳染病疫情風險，進一步強化了疾控系統內部業務管理，細化實化了傳染病疫情風險評估的具體要求。
風險評估是增強傳染病疫情早期監測預警能力，防范和化解公共衛生風險的重要手段。辦法明確，各級疾病預防控制機構應定期開展日常風險評估。國家級和省級疾病預防控制機構每周、市級和縣級疾病預防控制機構每月開展一次日常風險評估。日常風險評估頻次可根據疫情發展態勢和工作需要動態調整。
根據辦法，在常規監測或日常風險評估中發現以下異常情形時，當地疾病預防控制機構應開展專題風險評估，包括：發現新發突發急性傳染病、甲類或按甲類管理的法定傳染??；國外發生、國內尚未發生的傳染病輸入我國并出現本土傳播；傳染病常見的流行模式發生明顯改變、發病率或死亡率異常升高或地區分布明顯擴大；發現群體性不明原因疾病，或2例及以上的聚集性重癥與死亡病例等情形。
